Раньше, ещё в декабре туда заходил единственный боровичский автобус. Уходил из СПб утром. Сейчас глянул в расписание и обалдел: в 21 час уходит. А про обратный не напмсали
http://www.avokzal.ru/timetable/
Кто что знает?

Вы не туда посмотрели. В 21-00 отправляется автобус №940, который идёт в Боровичи через В. Новгород, а в М. Вишеру не заходит.
А вот автобус №939 на Боровичи отправляется в 8-30 и идёт через Малую Вишеру. Так что ничего не изменилось, можете спокойно ехать.