Чем объясняется, какая электричка со стороны Москвы и Голутвина приходит в Рязань-1 и какая приходит в Рязань-2? Количество приходящих и отправляющихся электричек не совпадает, их, что перегоняют между вокзалами? Зачем?
Есть ли транзитные электрички через Рязань-1, например, Голутвин-Кустаревка?

Нет, электрички не перегоняют, они завязаны в общий оборот с электричками маршрутов Рязань-Узуново и Рязань-Кустаревка. Поэтому и кажется, что количество не равно.
Сквозных электричке Голутвин-Кустаревка формально нет, фактически есть, хотя официально на вокзале об этом не объявляется.

На участке Рыбное каждая электричка находится в обороте либо западного хода ( 10-12 вагонов ), либо восточного ( короткие составы ).
И потом, почему Вы, DimaK, считаете прибывающие и отправляющиеся электрички по Рязани: филиал ТЧ Раменское в Рыбном находится - по Рыбному нужно и смотреть: сколько пришло, сколько ушло, причём нужно иметь расписание с указанием следования резервом.